El Intituto Pérez de Ayala está situado en el barrio de Ventanielles, tras el convenio que firmó el Arzobispado con el Ministerio de Educación en el año 1959, cuando quedó dividido en una Sección Femenina (que dependía del, en la actualida, IES Aramo) y otra Masculina (dependiente del hoy IES Alfonso II).
En 1965 se construyen los edificios que hoy constituyen los bloques A y B, y en el año 1969 el instituto pasño a ser INSTITUTO NACIONAL DE BACHILLERATO MIXTO.
Finalmente, se le da el nombre de "PÉREZ DE AYALA" y pasa a ser un INSTITUTO DE ENSEÑANZA SECUNDARIA.
Desde 2004 el IES participa en el Proyecto Bilingüe convenio del Ministerio de Educación y Ciencia y el British Council, como continuador del trabajo que se realiza en el Colegio Público de Ventanielles en Castellano e Inglés.
